Hay duplicidad de funciones entre Direcciones Generales, mismas que no se logran magnificar porque se han cambiado, literalmente, solo el nombre y las funciones permanecen, se añaden únicamente atribuciones. Esto traerá como consecuencia la dificultad operativa y burocrática dentro del sector ambiental, poniendo en riesgo el Derecho constitucional a un medio ambiente sano. Así mismo, con la creación de una Subsecretaría se hará más costosa la reestructuración lo que iría en contra de la Política de austeridad republicana del gobierno mexicano.