La creación de nuevas unidades dentro de SEMARNAT podría afectar la eficiencia operativa debido a la duplicidad de funciones, ya que si la nueva subsecretaría asume competencias que ya estaban a cargo de otras direcciones generales, puede haber conflicto de atribuciones, generando retrasos en la toma de decisiones. Además, se podría generar una mayor burocracia en los trámites internos, provocando procesos más largos dentro de SEMARNAT al agregar un nivel más en la jerarquía. Esto también podría causar retrasos en la emisión de permisos y autorizaciones ambientales si ciertas decisiones ahora pasan por una nueva instancia administrativa, aumentando los tiempos de respuesta. El análisis regulatorio debe reconocer estos costos y demostrar cómo la reorganización agilizará la operación de SEMARNAT en lugar de ralentizarla.