La norma incluye un elemento fundamental de discriminación a actores del Sistema Nacional de Ciencia, Tecnología e Innovación que consiste en decretar la terminación anticipada o la rescisión del reconocimiento a investigadoras e investigadores a quienes trabajan para universidades e instituciones de educación superior particulares si la institución para que laboran no continua con el pago de estímulos económicos a los investigadores. Varios factores son importantes. Primero: el posicionamiento y la pertenencia al SNII es un reconocimiento a la contribución de una persona al conocimiento y a la solución de problemas, que tienen un beneficio directo a la sociedad; este reconocimiento no se puede dar por terminado por acciones realizadas por un tercero sobre las que la investigadora o el investigador no tienen control. Segundo: la cancelación del reconocimiento reduce de manera significativa la posibilidad de que la investigadora o el investigador se contraten con universidades y centros públicos de investigación. Tercero: lo que la norma denomina como "obligaciones de pago" no se refiere a una responsabilidad laboral adquirida por las universidades e instituciones particulares de educación superior ante sus colaboradores, sino a la intención de CONAHCYT de incumplir una condición contractual adquirida frente a los investigadores y que ahora pretende sea adquirida por otras instituciones. Esta disposición niega derechos a personas concretas y puede generar una afectación reputacional, profesional y laboral significativa que en ningún momento es culpa de la persona afectada.